Dari sekian banyak SMA di kabupaten Sumenep, SMA Negeri 1 Sumenep merupakan satu-satunya Sekolah tingkat SMA yang ditugas untuk menjadi sekolah Rintisan Kategori Mandiri. Dimana, hal ini merupakan pelopor dari sekolah lain yang nantinya tahun 2010 wajib menjadi Sekolah Kategori Mandiri. Program Pemerintah ini wajib dilaksanakan oleh seluruh Sekolah di seluruh Indonesia dan sudah harus terealisasi dan dijalankan pada tahun 2010. Program Pemerintah ini sebenarnya akan merubah seluruh sistem yang ada disekolah, salah satu contohnya adalah akan merubah sistem sekolah menjadi SKS (Sistem Kredit Semester) dan siswa tidak akan selalu tetap pada satu kelas, tetapi akan terjadi Moving Class dimana siswa akan masuk kelas sesuai dengan jadwal dan kelas yang telah ditentukan oleh Kurikulum. Bahkan KBM (Kegiatan Belajar Mengajar) pun tidak harus dimulai dari pagi hari jam 7.00, tetapi bisa saja dimulai di sore hari, atau juga bisa hanya masuk siang saja.(fajar)